1. 흥미롭게도, 니고데모 이야기와 세례 요한의 증거는 대화 구조 상 대칭을 이루고 있습니다. 먼저 소개글로 시작하고 (prologue), 둘 사이의 대화가 이어지며, 독백으로 끝납니다. (ref. C. Marvin Pate, The Writings of John: A Survey of th eGospel, Epistles, and Apocalypse)

                    prolugue    dialogue    monologue

    니고데모     2:23-25      3:1-12       3:13-21

    세례요한     3:22-24      3:25-30     3:31-36

2. 헤롯 대왕은 이두메 (에돔 지역) 출신으로 유대인들에게는 그 정통성을 인정받지 못했고, 이로 인해 많은 열등감이 있었으며, 유대인들의 환심을 얻기 위해 여러 가지 대규모 토목 공사를 단행했습니다. 그 중에 대표적인 것이 예루살렘 성전 증축으로 BC 20년부터 시작했고, 그의 사후에도 계속되어 AD 64년에 마무리 되었습니다. (물론, 안타깝게도 그 웅장한 상아 건축물-솔로몬 회랑-이 AD 70년에 성전과 함께 돌 위에 돌 하나도 남기지 않고 모두 무너졌지만요.) 사람들의 말처럼 예수님의 성전청결 당시 이미 48년 동안이나 그 건축이 진행 중이었습니다. 

    많은 학자들이 성전청결 사건이 (예수님 사역의 마지막 한 주에) 한번만 있었던 것으로 보며, 요한이 메시아의 시대 즉 하나님나라의 시작을 선포하는 의미로 요한복음 서두에 가나 혼인잔치의 기적과 성전청결사건을 함께 배치해 놓았다고 봅니다. 

3. 모든 민족을 위한 예배 처소의 완성은 더 이상 성전이 아니라 새하늘과 새땅 (좀 더 좁혀 초점을 맞춰) 새예루살렘이 되고, 모든 민족이 그곳에 와서 각각 자신들에게 허락된 고유의 문화로 주님을 예배하게 될 것이 요한계시록에 기록되어 있습니다 (계 22:10-27). 2년차 12/30일 묵상글 참조. 

4. 니고데모가 자신의 신분을 감안하여 낮에 예수님 방문을 꺼리고 밤에 찾아왔지만, 그는 상징적으로 어둠에서 빛되신 예수님께로 나아온 셈입니다. 천국에 들어간다는 말은 곧 천국의 실재를 체험한다는 말이며, 니고데모는 이후에 두 번 더 언급되면서, 온전히 예수님의 제자가 되었음을 보여줍니다 (7:50-51, 19:39-42). 

5. 당시 중간기에는 경건하게 하나님을 믿었던 사람들을 하나님의 아들이라고 불렀고 (다음의 외경들에서 그 예들을 찾아 볼 수 있음. 솔로몬의 지혜서 5:5, 솔로몬의 시편 17:30, 시락 4:10 등등), 요한의 동시대 랍비들도 유대교로 개종하고 세례 받은 사람들을 '새로 갓태어난 아이'라고 불렀던 것을 보면, '거듭남' 혹은 '위로부터(/하나님께로부터) 남'의 의미가 예수님을 믿음으로 하나님의 자녀됨(요 1:12)을 뜻하는 것으로 볼 수 있습니다.